本剧讲述了我国明朝伟大的医药学家李时珍(公元1518年－1593年)富有传奇色彩的一生和跌宕起伏的情感历程。
　　李时珍从小对医学和本草就有着浓厚的兴趣，长大后因医术高超和楚王举荐而进入北京太医院。在波云诡谲的宫廷斗争中，他始终坚持医者救人的原则，从而得罪了严世蕃，甚至嘉靖皇帝；他还与制贩假药和迷信炼丹做了坚决的斗争。离开太医院之后，他以非凡的毅力和精神重修本草，编撰完成科学巨著《本草纲目》。
　　同时，该剧还描写了李时珍和民女吴斯语、郡主朱苌葶的感情纠葛，以及与义弟张行义等人的友情恩怨。剧情错综复杂，悱恻动人，让人在欣赏故事时充分感悟人生和情感真谛。